Mini manuel de génétique 2e édition

Mini manuel de génétique 2e édition 


Cours + QCM/QROC

 Table des matières

 1 Éléments de génétique mendélienne 1 1.1 La démarche de Gregor Mendel 1 Le modèle 3:1 2 Le modèle 9:3:3:1 4 Vérification expérimentale des deux modèles par le croisement test 5 Méthode de calcul des rapports génétiques dans les hybrides 6 1.2 Le modèle 3:1 chez l’homme 8 La phénylcétonurie 8 La perception de l’amertume par l’homme et les grands singes 12 1.3 Dominance et récessivité, multiallélisme 13 Aspects généraux 13 Illustration par un exemple simple 14 Le cas des groupes sanguins ABH 16 Le cas du gène de la tyrosinase 16 1.4 Allèles létaux 17 1.5 Actualité du concept de gène 18 Un concept historique 18 Un concept dynamique 19 Points clefs 21 QCM - QROC 22 2 Mutations et sélection 25 2.1 Origine des mutations 25 Les mutations liées à des erreurs de duplication de l’ADN 27 Les mutations provoquées par des agents mutagènes 28 978210055530-livre.fm Page VII Jeudi, 21. octobre 2010 5:46 17 VIII Génétique 2.2 Les différents types de mutations modifiant ou non la fonction 33 Les mutations géniques 33 Les mutations chromosomiques : amplifications, délétions, translocations, inversions, perte d’hétérozygotie 35 Les mutations pertes ou gains de fonction 37 Autres types de mutations : phénotypiques, biochimiques et conditionnelles 38 Nomenclature 38 2.3 La notion de paramutation 38 2.4 Effets des mutations 40 Effets défavorables 40 Effets favorables 40 2.5 La notion de sélection 41 La sélection naturelle 41 La sélection artificielle 44 Relations entre sélection et variation génétique 46 2.6 La distinction entre phénotype et génotype 47 2.7 Liaison génétique et déséquilibre de liaison 48 Liaison génétique et sélection 48 Table des matières IX 3.2 La structure et la fonction des chromosomes eucaryotes 68 La structure du nucléosome 68 La structure et le remodelage de la chromatine 71 La structure des chromosomes au cours du cycle cellulaire 71 3.3 La structure des génomes 74 Qu’est-ce qu’un génome ? 74 La taille des génomes 74 Les génomes viraux 75 Les génomes procaryotes 75 Les génomes eucaryotes 76 Les génomes d’organites 77 3.4 Le séquençage des génomes 77 Fragmenter puis assembler 78 Le séquençage du génome humain 80 Points clefs 87 QCM - QROC 89 4 Introduction à la génétique des micro-organismes 92 4.1 Génétique bactérienne 93 Mutants bactériens 93 Conjugaison bactérienne 94 La transformation bactérienne 102 4.2 Génétique des bactériophages 105 Le cycle biologique des bactériophages 105 La lysogénie 106 La transduction 107 4.3 Test de complémentation ou test d’allélisme fonctionnel 111 4.4 Test d’allélisme structural 113 4.5 Génétique de la levure 115 Les groupes de complémentation et dénombrement des gènes 117 Invalidation de gènes chez la levure 118 Les levures eucaryotes modèles et outils 120 978210055530-livre.fm Page IX Jeudi, 21. octobre 2010 5:46 17 X Génétique 4.6 Micro-organismes et génie génétique 120 Points clefs 123 QCM - QROC 124 5 Expression des gènes et des génomes 127 5.1 Expression des gènes : la transcription de l’ADN 127 Les protéines nécessaires à la transcription 127 L’exemple historique de l’opéron lactose de E. Coli 129 Une même protéine régulatrice peut être répressive ou activatrice 131 Les isolateurs eucaryotes 132 La régulation transcriptionnelle à l’échelle de la chromatine 135 5.2 Expression des gènes : l’épissage alternatif des transcrits 135 Gènes morcelés et épissage des transcrits 135 Épissage alternatif et régulation 137 5.3 Expression des gènes : régulation traductionnelle 138 5.4 Régulations épigénétiques de l’expression des gènes 141 Modifications biochimiques des histones et de l’ADN : l’épigénomique 141 Génétique et épigénétique des jumeaux monozygotiques 142 Modifications post-transcriptionnelles des transcrits par « éditing » 143 Empreintes parentales 143 5.5 Les réseaux de régulation de l’expression des gènes 146 Analyse de l’expression à l’échelle des génomes : les outils de la génomique 146 Les notions de hiérarchie et de réseaux de gènes 150 Autres « omiques » 153 5.6 LA GÉNOMIQUE EN SANTÉ HUMAINE ET POUR LA SÉLECTION ANIMALE 153 La génomique en santé humaine 153 La génomique pour la sélection animale 161 978210055530-livre.fm Page X Jeudi, 21. octobre 2010 5:46 17 Table des matières XI Points clefs 162 QCM - QROC 164 6 Transmission et hérédité 167 6.1 Les divisions cellulaires 167 La mitose 167 La méiose 169 La recombinaison méiotique 171 6.2 Liaison génétique et cartographie 177 Fréquence de recombinaison intrachromosomique et distance génétique 178 Comment cartographier plus de deux gènes liés 178 La notion d’interférence entre crossing-over 182 6.3 Cartographie des centromères et analyse des tétrades linéaires 183 Inversion chromosomique et cartographie 184 6.4 Cytogénétique et assignation chromosomique 186 6.5 Analyse de la liaison génétique et test du CHI-deux ou c2 188 6.6 Hérédité liée au sexe 190 Déterminisme du sexe 191 Hérédité liée au chromosome X 192 6.7 Transmission de transgènes 193 6.8 Dérives aux lois de Mendel dans la transmission des caractères 197 L’épistasie 197 Les gènes suppresseurs 198 Points clefs 199 QCM - QROC 200 7 Génétique de l’évolution et du développement des organismes 204 7.1 Génétique de l’évolution 204 Macro et microévolution : aperçu général et définitions 205 Les racines d’une nouvelle discipline : l’évo-dévo 206 978210055530-livre.fm Page XI Jeudi, 21. octobre 2010 5:46 17 XII Génétique 7.2 Une brève histoire de l’origine des gènes 207 L’ARN a-t-il précédé l’ADN comme support moléculaire de l’hérédité ? 207 Origine des introns et des exons, structure des gènes et évolution 208 7.3 La boîte à outils génétiques du développement 209 Les gènes du développement 211 Le modèle historique de la drosophile 214 7.4 D’où vient la nouveauté en matière de développement ? 218 L’évolution de l’expression génique 219 La régulation en cis et en trans de l’expression génique 219 Estimation simplifiée de la taille moyenne des sites régulateurs mutables pour un gène standard 221 Modifications épigénétiques de l’expression génique 224 Points clefs 224 QCM - QROC 226 8 Génétique des populations 228 8.1 Calculs des fréquences génotypiques et alléliques 229 8.2 Le modèle de Hardy-Weinberg 231 Conditions requises pour l’application du modèle 231 Généralisation du modèle de Hardy-Weinberg 232 Mise en évidence de la relation entre équilibre allélique et équilibre génotypique 234 8.3 Applications aux allèles rares 235 8.4 Parenté et coefficient de consanguinité 237 8.5 Modélisation de la sélection naturelle 239 Points clefs 242 QCM - QROC 243 Glossaire 245 Index 255



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